※个人概况 中国计量科学研究院，副研究员，博士研究生导师 致力于蛋白质组及其翻译后修饰组的创新技术研究，建立了系列标准化分析流程与大数据生信分析策略，参与了绘制国际首个早期肝细胞癌分子特征图谱，实现了早期肝细胞癌的精准分子分型，为蛋白质组驱动的精准医疗研究(PDPM)做出了突出贡献；绘制了肺癌、脑癌、结直肠癌等重大疾病的多组学特征图谱，开发了配套的人工智能工具与软件，为疾病的精准诊断和治疗提供重要支撑；正深入研究蛋白质(组)的精准检测与计量标准，以确保数据质量和标准化使用。至今，已在Nature, Cell, Sci.China Life Sci., Cancer Letters，Communications Biology，Briefings in Bioinformatics等杂志发表学术论文30余篇。国家重点研发计划重点专项项目负责人。 ※研究方向 肿瘤生物学、生物信息学、蛋白质组学、人工智能及大数据计量研究 ※教育经历 （1）2014-09 至 2019-07，北京工业大学/国家蛋白质组科学中心，生物医学工程，博士 ，导师：钱小红 （2）2011-07 至 2014-07，江西师范大学/中科院水生生物研究所，生物化工，硕士 ，导师：彭以元/李仁辉 （3）2008-09 至 2010-07，华中农业大学，渔业资源，其他 ，导师：危起伟 （4）2004-09 至 2008-07，西南科技大学，生物工程，学士 ※工作经历 2019年-至今，中国计量科学研究院前沿计量科学中心，副研究员 ※主讲课程 生物信息学、蛋白质组学等 ※学术兼职 中国农业大学/中国计量大学兼职研究生导师 ※指导研究生 近年来共指导硕士及博士研究生10余名，已培养毕业生6人，指导的员工均以第一作者或共同作者身份发表SCI论文数篇，毕业员工已在高校、研究机构和企业承担重要科研或技术岗位。 ※荣誉称号 无 ※承担课题 主持国家重点研发计划1项；市场监督管理总局项目1项；计量院基本业务费项目3项；成果转化项目4项 ※获奖情况 北京市优秀毕业生； 邹承鲁杰出论文奖； 中国仪器仪表学会科学技术进步一等奖1项 ※发表论文 第一作者 1. Jiang Y#, Sun A#, Zhao Y# (共一), et al. Proteomics identifies new therapeutic targets of early-stage hepatocellular carcinoma[J]. Nature, 2019, 567(7747): 257-261. Zhao Y, Zhang L, Zhang Y, et al. Identification of hedgehog signaling as a potential oncogenic driver in an aggressive subclass of human hepatocellular carcinoma: A reanalysis of the TCGA cohort[J]. Science China Life Sciences, 2019, 62: 1481-1491. 2. Xu J Y, Zhang C, Zhao Y（参与）, et al. Integrative proteomic characterization of human lung adenocarcinoma[J]. Cell, 2020, 182(1): 245-261. e17. 3. Gao H, Zhu Y, Zhao Y（参与）, et al. iDIA-QC: AI-empowered data-independent acquisition mass spectrometry-based quality control[J]. Nature Communications, 2025, 16(1): 892. 4. Zhao Y, Zhang Y, Meng B, et al. A Novel Integrated Pipeline for Site-Specific Quantification of N-glycosylation[J]. Phenomics, 2024: 1-14. 5. Zhao Y, Xue Q, Wang M, et al. Evolution of mass spectrometry instruments and techniques for blood proteomics[J]. Journal of Proteome Research, 2023, 22(4): 1009-1023. 6. Zhao Y, Zhang D, Meng B, et al. Integrated proteomic and glycoproteomic analysis reveals heterogeneity and molecular signatures of brain metastases from lung adenocarcinomas[J]. Cancer Letters, 2024, 605: 217262. 7. Zhao Y, Wang S, Huang J, et al. TSARseqNovo: A Transformer-Based Semi-Autoregressive Framework for High-Speed and Accurate De Novo Peptide Sequencing[J]. Communications Biology, 2025. 8. Huang J#, Zhao Y#（共一）, Meng B, et al. SEAOP: a statistical ensemble approach for outlier detection in quantitative proteomics data[J]. Briefings in Bioinformatics, 2024, 25(3): bbae129. 9. Zhao Y, Wang M, Meng B, et al. Identification of dysregulated complement activation pathways driven by N-glycosylation alterations in T2D patients[J]. Frontiers in Chemistry, 2021, 9: 677621. 通讯来源：威廉希尔WilliamHill官方网站 1. Zeng J, Rong W, Meng B, Zheng L, Peng T, Zhai R, Jiang Y, Xiao T, Fang X, Zhang Y*, Zhao Y*, Xinhua Dai*. Integrated plasma proteomics and N‐glycoproteomics reveals alterations in the N‐glycosylation in Chinese hepatocellular carcinoma patients[J]. PROTEOMICS–Clinical Applications, 2024: 2300029. 2. 陆澳, 孟波, 赵佳威, 廖焕玥, 叶子弘, 方向, 赵洋*, 福尔马林固定石蜡包埋组织样本的蛋白质组制备技术研究, 分析化学, Volume 53, Issue 1, 2025, Pages 84-93, ISSN 0253-3820. 3. 赵佳威，孟波，陆澳，韩梓星，叶子弘，赵洋*, 木犀草素对结直肠癌SW620细胞生长抑制作用的蛋白质组学机制研究, 分析化学, Volume 53, Issue 3, 2025, ISSN 0253-3820. 4. Huang Y, Meng B, Qin Y, Liu J, Lu A, Dai X, Zhao Y*, Ge L*. Comparative Proteomic Atlas of Two Soybean Varieties with Contrasting Seed Oil and Protein Content[J]. J. Agric. Food Chem, 2025, 73, 2279−2288. 5. Meng B, Huang Y, Lu A, Liao H, Zhai R, Gong X, Dong L, Jiang Y, Dai X, Fang X*, Zhao Y*. Enhanced Analysis of Low-Abundance Proteins in Soybean Seeds Using Advanced Mass Spectrometry. Int. J. Mol. Sci. 2025, 26, 949. 6. Huang J, Li Y, Meng B, Zhang Y, Wei Y, Dai X, An D, Zhao Y*, Fang X*. ProteoNet: A CNN-based framework for analyzing proteomics MS-RGB images[J]. iScience, 2024, 27(12). 7. Zhang Y, Zeng W, Zhao Y*, et al. New methods, techniques and applications in clinical glycoproteomics[J]. Frontiers in Molecular Biosciences, 2023, 10: 1170818. 8. Mao Y, Su T, Lin T, Yang H, Zhao Y*, Zhang Y*, Dai X*. Comprehensive Plasma N-Glycoproteome Profiling Based on EThcD-sceHCD-MS/MS. Front Chem. 2022 Jun 20;10:920009. |
